本發明提供了一種嵌入式航海數據采集系統,包括傳感器、探測器、反饋系統、數據采集系統、信息控制融合中心、控制系統;所述傳感器數量為八個以上,傳感器通過無線傳感器網絡連接探測器;所述探測器、反饋系統、數據采集系統、信息控制融合中心依次信號連接;反饋系統和信息控制融合中心還分別與控制系統信號連接;所述傳感器分組連接多個探測器,每個探測器與反饋系統、控制系統一一對應。本發明基于傳感器分組的設置,利用無線傳感器網絡,每一傳感器成為整個系統的一個節點,而每組的匯聚節點針對每組匯聚數據進行采集匯總,系統的數據匯聚時間以及最大延遲時間得到有效提高,有效提高數據采集的有效性。