本發明公開了一種代謝組學細胞快速取樣淬滅儀,其特征在于:包括可收集細胞培養物的過濾轉筒,所述的過濾轉筒包括過濾吸干區,細胞洗滌區和卸料區,所述的過濾吸干區和細胞洗滌區分別與真空管相連接,所述的卸料區與壓縮空氣管連接,在所述的細胞洗滌區外側設有細胞洗滌溶液噴頭,在所述的卸料區外設有可將過濾轉筒上細胞培養物刮下的冷凍刮刀,所述的冷凍刮刀一端浸沒在冷凍源中。本發明的目的是為了克服現有技術中的不足之處,提供一種結構簡單,能自動化地完成取樣、洗滌、淬滅全過程操作,便于將取樣淬滅過程時間控制在盡可能短的范圍內的代謝組學細胞快速取樣淬滅儀。