本發明公開一種操作簡單、高效且可分別得到分子量大于100kDa、20-50?kDa以及2-10kDa的牡蠣多糖組分的牡蠣多糖的制備方法,依次按照如下步驟進行:將水加入到牡蠣肉中,勻漿;水與牡蠣肉的比例為1~5L:100~500g;將勻漿在50~100℃條件下加熱10~60min,在1000~10000rpm條件下離心10~30min,取上清液;將上清液加入到疏水樹脂柱中進行層析,分別以水、5%乙醇及15%乙醇洗脫,每次洗脫至洗脫液中不含糖;分別得到水洗脫組分、5%乙醇洗脫組分及15%乙醇洗脫組分;分別向水洗脫組分、5%乙醇洗脫組分及15%乙醇洗脫組分中加入80%乙醇至飽和濃度,得三種沉淀。