本發明涉及含有穿琥寧的脂質體凍干粉制劑及其制備方法。該制劑以穿琥寧為有效成分并含有作為脂質成份的磷脂、乳化劑、凍干保護劑和輔料組成。其中,穿琥寧與磷脂類物質的重量比為1∶1~200份,0.0001~50份乳化劑;按1份磷脂加入0.1~30份凍干保護劑和適量輔料的比例制成凍干制劑,既能顯著提高藥物的貯存穩定性,又能使穿琥寧脂質體凍干粉在加入注射用水再分散后,能以任意比例與注射用水稀釋給藥而不產生沉淀和降解產物。凍干制劑的包封率為50%~100%,粒徑為40nm~1000nm。本發明可制成針劑、口服劑和醫藥上允許的劑型,適合工業化生產,具有成本低,療效好,副作用少,制造工藝簡單等優點。