一種多相機光學推掃衛星在軌幾何定標方法及系統,包括對各個相機進行分步內外定標,獲取各個相機的內外定標參數;利用外業控制點作為定向點,重新對各個相機基于最小二乘平差解算外定標參數, 確定多載荷的相對安裝角關系;對作為主載荷的相機利用全球多個定標場數據作為定向點,基于最小二乘平差重新求解外定標參數,并轉化為相應最終的安裝矩陣;根據相對安裝角關系求取其他非主載荷最終的安裝矩陣,得到各相機最終的外定標參數。本發明針對多相機推掃式衛星的成像特點,充分考慮了多載荷相互之間的相對安裝關系,實現對多相機推掃式衛星的高精度幾何定標,提高后續多視立體影像的相對幾何精度。